Laboratoire de Cristallographie, Résonance Magnétique et Modélisations

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Informatique

Le service informatique

Equipements informatiques

Serveurs

  • Infrastructure de virtualisation sous ProxmoxVE constitué d’une grappe de serveurs avec 5 nœuds PVE et un Proxmox Backup Server. Cette infrastructure supporte la haute disponibilité en tolérant la panne de 2 nœuds en même temps et dispose de 128 cœurs, 516 Go de RAM et 19 To de stockage dont 4 To d’espace hyperconvergé supporté par Ceph.
  • Serveur de sauvegarde des données personnelles sous UrBackup (11 To).
  • Serveur de stockage des données de recherche (107 To).
  • Serveur de fichiers hébergeant un espace partagé, des espaces de travail privé et un espace personnel pour chaque membre sous TrueNAS Scale (7 To).
  • Capteur de température et d’humidité sur un Raspberry Pi sous Debian.
  • iDRAC fonctionnel sur les 9 serveurs rack Dell du laboratoire, permettant la surveillance et l’alerte en cas de soucis sur ces derniers.
Close-up of network cables and ports in a server rack, showcasing connectivity.

Services virtualisés

  • Service SSH, passerelle sécurisée d’accès au laboratoire.
  • Service SVN pour géré l’évolution des versions et permettre la synchronisation entre les développeurs.
  • Service de forge logiciel avec Gitlab et deux compilateurs déporté gitlab-runner permettant la compilation sous Windows et sous Linux.
  • Service de suivie de bug avec Bugzilla
  • Service de réservation de salle avec MRBS.
  • Service web permettant l’extraction d’images LIFF (Leica) vers des pages web consultable (programmé en python).
  • Service de configuration et de gestion des ordinateur avec Ansible.
  • Service de manipulation de fichier PDF avec Stirling PDF.
  • Service de bastion de connexion permettant la centralisation de la gestion des autorisation de prise de contrôle à distance avec Guacamole Apache.
  • Service d’inventaire avec GLPI.
  • Service de smart office avec EGroupware.
  • Service de prise de contrôle à distance via serveur relai avec RustDesk.
  • Service web hébergeant l’Intranet du laboratoire.
  • Service web hébergeant le site de photos pour le laboratoire et un autre site pour « Musée du Premier Cycle »
  • Service web hébergeant CIMS (International Uninon of Crystallography) et MathCryst (Commission on Mathematical and Theoretical Crystallography)
  • Service de surveillance et d’alerte de disponibilité des services et des serveurs du laboratoire avec Uptime Kuma.
  • Service de gestion de queue d’impressions avec CUPS.
  • Console de gestion de systèmes permettant la gestion des serveurs Dell avec OpenManage Enterprise.

Calculateurs

En plus de l’utilisation des centres de calculs nationaux certains chercheurs du laboratoire utilisent des calculateurs locaux :

  • 1 cluster de calcul Linux (CentOS) Beowulf de 15 nœuds de calculs biprocesseurs Intel XEON DP 3,06 GHz
  • 1 cluster de calcul Linux (CentOS) de 20 nœuds biprocesseurs Intel Xeon
  • 5 serveurs et stations de travail rackable :
    – PowerEdge R720 (Debian) : 16 cœurs, 192 Go RAM, 5 To HDD
    – PowerEdge R940 (CentOS) : 16 cœurs, 192 Go RAM, 900 Go HDD
    – PowerEdge R640 (Debian) : 56 cœurs, 512 Go RAM, 3 To HDD
    – Precision 7960 Rack (Debian) : 96 cœurs, 1024 Go RAM, 6 To SSD
    – Precision 7960 Rack (Debian) : 96 cœurs, 1024 Go RAM, 4 To SSD
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A web developer working on code in a modern office setting with multiple devices.

Postes personnels

  • 173 machines : 104 ordinateurs fixe, 39 ordinateurs portable, 9 serveurs rackable, 7 machines virtuelles, 13 containeurs Linux et un Raspberry Pi.
  • 126 ordinateurs sous Windows et 8 sous Linux.
  • Tous les OS Linux sont à 99% sous Debian, quelques CentOS et Ubuntu.
  • 1 station Linux pour l’équipe BioMIMIC stockant des données synchrotron.
  • 1 station Linux avec GPU Nvidia RTX A5000 pour l’équipe BioMIMIC permettant l’utilisation de AlphaFold et le stockage des données synchrotron.

Postes communs

Les postes communs sont mis à disposition des stagiaires, des chercheurs invités pour les TP de façons ponctuel.
10 ordinateurs Windows identique (clonable) sont disponible pour les TP, une vingtaine de PC fixe disponible en prêt et 2-3 PC portables disponible en prêt également.

A contemporary office setup featuring computers on desks with modern flat screens.
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Réseau

L’ensemble du réseau à l’intérieur du laboratoire est géré par le service via 4 switch 48 ports Gigabit Cisco manageable dans une armoire de brassage.

Programmation

Domaines

  • Script batch, bash… Linux et Windows.
  • Script python.
  • Programmation web HTML5, PHP, CSS, Ajax, JavaScript…
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Plateforme informatique

Equipe

Detailed view of a cooling fan inside a modern gaming PC setup.
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