Sabine Bouguet-Bonnet

Sabine Bouguet-Bonnet


Maitre de conférences




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courrielsabine.bonnet@univ-lorraine.fr



carriere_icn Carrière:


Post-doc (octobre 2004 – février 2006)

 

stage post-doctoral dans le département de physiologie et biophysique de l’école de Médecine à Cleveland

équipe de Matthias Buck, Case Western Reserve University, Cleveland, Ohio, USA

 

Sujet: étude de la petite GTPase Rac1 dans sa forme active, et de son interaction avec le domaine cytoplasmique de la plexin-B1.

Liens: Case Western Reserve University, département de physiologie et biophysique, laboratoire de Matthias Buck.

 

 

Thèse (2000-2004)

 

Laboratoire de Méthodologie RMN, FRE-CNRS 2415, université Henri Poincaré, Nancy, France

 

Sujet: corrélation croisée entre mécanisme dipolaire et anisotropie de déplacement chimique. Dynamique des protéines en solution.Lorem ipsu

 

Directeur de thèse: M Pierre Mutzenhardt, professeur université H.Poincaré, Nancy I.

 

Résumé :

Les travaux présentés dans ce mémoire concernent la détermination et l’exploitation des paramètres de relaxation de l’isotope-15 de l’azote dans des protéines enrichies.

La première partie introduit de manière générale les mécanismes de relaxation de spin. Le deuxième chapitre est consacré à la description des méthodes de mesure des paramètres de relaxation dans les protéines. De nouvelles méthodes permettant la mesure du terme de corrélation croisée provenant de l’interférence entre le mécanisme dipolaire (NH) et l’anisotropie de déplacement chimique (csa) de l’azote-15 sont exposées. Le troisième chapitre traite de la manière d’extraire des paramètres de relaxation des informations structurales et dynamiques. L’approche est basée sur une analyse résidu par résidu de la relaxation mesurée à plusieurs valeurs du champ magnétique statique, et s’avère compatible avec la détermination de l’anisotropie globale de réorientation des molécules. L’intérêt d’inclure les paramètres de corrélation croisée est également exposé pour la détermination simultanée du csa et de l’échange chimique.

 

 

2004 – Université Henri Poincaré, Nancy, France
Doctorat de l’Université Nancy I, Mention très honorable, félicitations du jury

 

2000 – Université Henri Poincaré, Nancy, France

DEA de Chimie et Physico-chimie Moléculaires, Mention Bien, class. 2eme

Magistère de Génie Moléculaire, Matériaux et Procédés, Mention Bien, major

 

1999 – Université Henri Poincaré, Nancy, France

Maîtrise de Chimie physique, Mention Assez Bien

 

1998 – Université Henri Poincaré, Nancy, France

Licence de Chimie physique

 

1997 – Université Henri Poincaré, Nancy, France

DEUG en Sciences de la Matière, Mention Bien



recherche_icn Domaine de recherche:


Spécialiste en Résonance Magnétique Nucléaire.



mission_icn Mission:


Maître de conférences (recherches scientifiques dans l’équipe de méthodologie RMN de l’UMR UHP-CNRS 7565, et activités d’enseignement à l’IUT Nancy-Brabois, département de Génie Chimique et Génie des Procédés, et département de Génie Biologique Agro-Alimentaire, Nancy, France).



enseignement_icn Enseignement


2006 – Université H.Poincaré, Nancy, Maitre de conférences
Départements de Génie Chimie, Génie des Procédés et Génie Biologique Agro-Alimentaire de l’IUT Nancy-Brabois.
Enseignements de chimie physique, chimie analytique, bureautique, mathématiques, physique appliquée.

 

2003-2004 – Université H.Poincaré, Nancy, ATER
Enseignements de chimie physique (premier cycle Sciences de la Vie et Sciences de la Matière), RMN (de la seconde année à la maîtrise), spectrométrie de masse (seconde année Sciences de la Vie), thermodynamique chimique (première année Sciences de la Vie)
Volume horaire : 96h eq. TD/an

 

2001-2003 – Université H.Poincaré, Nancy, Moniteur de l’enseignement supérieur
Enseignements de chimie physique (premier cycle Sciences de la Vie et Sciences de la Matière), RMN (de la seconde année à la maîtrise),
Volume horaire : 64h eq. TD/an

 

2000-2001 – Ecole Nationale Supérieure des Industries Chimiques (ENSIC), Nancy, Moniteur de l’enseignement supérieur
Travaux pratiques de chimie physique
Volume horaire : 64h eq. TD/an

 

1997-2000 – Université Henri Poincaré, Nancy, Tutorat auprès des étudiants de 1ere année
Enseignements de physique
Volume horaire : 60h/an


publication_icn Publications:


Karaki N., Aljawish A., Muniglia L., Bouguet-Bonnet S., Leclerc S., Paris C., Jasniewski J., Humeau-Virot C.
Functionalization of pectin with laccase-mediated oxidation products of ferulic acid
Enzyme and Microbial Technology 104 (2017) 1-8 DOI link

Terenzi C., Bouguet-Bonnet S., Canet D.
Direct1H NMR evidence of spin-rotation coupling as a source ofpara?ortho-H2conversion in diamagnetic solvents
The Journal of Chemical Physics 146 (2017) 154203 DOI link

Wathier L., Venet T., Thomas A., Nunge H., Bonfanti E., Cosnier F., Parietti-Winkler C., Campo P., Tsan P., Bouguet-Bonnet S., Gansmüller A.
Membrane fluidity does not explain how solvents act on the middle-ear reflex
NeuroToxicology 57 (2016) 13-21 DOI link

Terenzi C., Bouguet-Bonnet S., Canet D.
Electron Spin Polarization Transfer to ortho -H 2 by Interaction of para -H 2 with Paramagnetic Species: A Key to a Novel para - ortho Conversion Mechanism
Journal of Physical Chemistry Letters 6 (2015) 1611-1615 DOI link

Zerbetto M., Anderson R., Bouguet-Bonnet S., Rech M., Zhang L., Meirovitch E., Polimeno A., Buck M.
Analysis of 15N-1H NMR relaxation in proteins by a combined experimental and molecular dynamics simulation approach: ps-ns dynamics of the Rho GTPase binding domain of plexin-B1 in the dimeric state indicates allosteric pathways
Journal of Physical Chemistry B 117 (2013) 174-184 DOI link

Steiner E., Bouguet-Bonnet S., Robert A., Canet D.
"Relaxometry" experiments and analysis of dispersion curves: an illustrative example of toluene in liquid and in an organogel phases
Concepts in Magnetic Resonance part A 40 (2012) 80-89 DOI link

Bouguet-Bonnet S., Yemloul M., Canet D.
New Application of Proton Nuclear Spin Relaxation Unraveling the Intermolecular Structural Features of Low-Molecular-Weight Organogel Fibers
Journal of the American Chemical Society 134 (2012) 10621-10627 DOI link

Zhang L., Bouguet-Bonnet S., Buck M.
Combining NMR and Molecular Dynamics Studies for Insights into the Allostery of Small GTPase-Protein Interactions
Methods in Molecular Biology 796 (2012) 235-259 DOI link

Canet D., Bouguet-Bonnet S., Leclerc S., Yemloul M.
Carbon-13 Heteronuclear Longitudinal Spin Relaxation for Geometrical (and Stereochemical) Determinations in Small or Medium Size Molecules.
Annual Reports on NMR Spectroscopy 74 (2011) 89-123 DOI link

Reineri F., Bouguet-Bonnet S., Canet D.
Creation and evolution of net proton hyperpolarization arising from para-hydrogenation
Journal of Magnetic Resonance 210 (2011) 107-112 DOI link

Yemloul M., Steiner E., Robert A., Bouguet-Bonnet S., Allix F., Jamart-Grégoire B., Canet D.
Solvent dynamical behavior in an organogel phase as studied by NMR relaxation and diffusion experiments
Journal of Physical Chemistry B 115 (2011) 2511-2517 DOI link

Steiner E., Bouguet-Bonnet S., Blin J.-L., Canet D.
Water behavior in mesoporous materials as studied by NMR relaxometry
Journal of Physical Chemistry A 115 (2011) 9941-9946 DOI link

CUC D., BOUGUET-BONNET S., MOREL-DESROSIERS N., MOREL J.-P., MUTZENHARDT P. and CANET D.
Location of a metallic cation complexed in a calixarene cavity as determined by calixarene C spin relaxation. Application to cesium and thallium complexedby p-Sulfonatocalx[4]arene in water
Journal of Physical Chemistry B 113 (2009) 3499-3503

CUC D., BOUGUET-BONNET S., MOREL-DESROSIERS N., MOREL J.-P., MUTZENHARDT P. and CANET D.
Behavior of Cesium and Thallium cations inside a calixarene cavity as probed by nuclear spin relaxation. Evidence of cation-pi interactions in water
Journal of Physical Chemistry B 113 (2009) 10800-10807

BOUGUET-BONNET S., REINERI F. and CANET D.
Effect of the static magnetic field strength on parahydrogen induced polarization NMR spectra
Journal of Chemical Physics 130 (2009) 234507

YEMLOUL M., BOUGUET-BONNET S., AI CHA BA L., KIRSCH G. and CANET D.
Selective HOESY experiments for stereochemical determinations
Magnetic Resonance in Chemistry 46 (2008) 939-942 DOI link

BOUGUET-BONNET S. and BUCK M.
Compensatory and long-range changes in picosecond-nanosecond main-chain dynamics upon complex formation: 15N relaxation analysis of the free and bound states of the ubiquitin-like domain of human Plexin-B1 and the small GTPase Rac1.
Journal of Molecular Biology 377 (2008) 1474-1487

N. COUDEVYLLE, M. ANTOINE, S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, S. BOSCHI-MULLER, G. BRANLANT, M.T. CUNG
Solution Structure and Backbone Dynamics of the Reduced Form and an Oxidized Form of E. coli Methionine Sulfoxide Reductase A (MsrA): Structural Insight of the MsrA Catalytic Cycle
J. Mol. Biol. 366 (2007) 193-206

D. CANET, S. BOUGUET-BONNET, C. AROULANDA, F. REINERI
About Long-Lived Nuclear Spin States Involved in Para-Hydrogenated Molecules
J. Am. Chem. Soc. 129 (2007) 1445-1449

V. ROPARS, S. BOUGUET-BONNET, D. AUGUIN, P. BARTHE, D. CANET, C. ROUMESTAND
Unraveling protein dynamics through fast spectral density mapping
J. Biomol. NMR 37 (2007) 159-177

BUCK M., BOUGUET-BONNET S., PASTOR R.W. and MACKRELL A.D.
Importance of the CMAP correction to the CHARMM22 Protein Force Field: dynamics of hen lysozyme
Biophysical Journal 90 (2006) 36-38

BOUGUET-BONNET S. and BUCK M.
1H, 15N, 13C assignments for the activated form of the small Rho-GTPase Rac1; comparison with the inactive GDP-bound state.
Journal of Biomolecular NMR 36 (2006) 51

S. BOUGUET-BONNET, S. LECLERC, P. MUTZENHARDT, D. CANET
HMBC-like experiment based on longitudinal csa/dipolar cross-correlation
J. Magn. Reson. 173 (2005) 29-33

S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, C. ROUMESTAND, D. CANET
The concept of effective correlation times for describing backbone motions in proteins. Part I. A residue-per-residue self-consistent analysis of multifield 15N relaxation parameters
Concepts Magn. Reson. 24A (2005) 1-9

S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, C. ROUMESTAND, D. CANET
The concept of effective correlation times for describing backbone motions in proteins. Part II. Tentative interpretation of the residue-specific correlation time in terms of overall rotation-diffusion
Concepts Magn. Reson. 24A (2005) 10-16

S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, D. CANET
Measurement of 15N csa/dipolar cross-correlation by means of spin state selective experiments
J. Biomol. NMR 30 (2004) 133-142

S. LECLERC, S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, J. BRONDEAU, D. CANET
Simulation of radio-frequency field inhomogeneity effects: application to pulse trains aimed at the determination of CSA-dipolar interference terms
Magn. Reson. Chem. 41 (2003) 769-775

D. CANET, S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT
On the calculation of cross-correlation spectral density functions within the model-free approach
Concepts in Magnetic Resonance 19A (2003) 65-70

S. BOUGUET-BONNET, P. MUTZENHARDT, D. CANET
An alternative spin-state selective pulse sequence element
Magn. Reson. Chem. 41 (2003) 1030-1033

S. BOUGUET-BONNET, M. ROCHAD, P. MUTZENHARDT, M. HENRY
Total assignment of 1H and 13C NMR spectra of three triterpene saponins from roots of Silene vulgaris (Moench) Garcke
Magn. Reson. Chem. 40 (2002) 618-621